辻井さんのコメントより。

【アカメの仔魚って同定できるの？】
＞産卵に関する生態がわかってないのですね。
＞寿命の短い年魚や２年魚なら産卵環境の悪化は即座に個体数の減少に
＞結びつきますが。
＞寿命の長い魚、特に年級群にしめる年長魚の割合の多い魚は、
＞減り始めたことに気づいたときはには既に遅しとなってしまいそうですね。
＞駿河湾で海洋大が使っているようなお化けのような大型プランクトンネットで
＞仔魚の分布を調べるとか。
＞でも仔魚の形態があらかじめわかってないと同定自体が不可能ですね。
＞人工授精がクローニングでもして仔魚を発生させるか。夢のまた夢。。。
＞M山先生なら詳しいですかね。

【年別の体長組成を蓄積し変化の推移を調べる】
＞個体数の減少はその原因別に以下のように体長組成の変化に現れます。

＞１．小型側にシフトする：大型魚の乱獲などが原因の場合
＞※ただし、ギルのように増えすぎて小型化するものもある

＞２．大型側にシフトする：溜池にバスが侵入した場合のコイやフナなど
＞仔稚魚の減少が原因の場合

＞う～ん、釣果データの解析だけでは難しそう。
＞量が比較的豊富な釣果データを補正するための精密なデータが必要ですね。。。

【釣果データを釣果データで補正する方法】
＞連投ごめんなさい。

＞Ａ．アカメかアカメの近縁種で、その生息環境が良好に保たれている
＞水域の釣果データと高知県における釣果データを比較する

＞Ｂ．高知県内を想定される生息水域ごと（？？）に多地点に分割し、
＞それぞれの釣果データを比較する

＞なお、比較するのは体長組成の変化です。上記のどちらも難しいですが。

＾＾＾＾＾＾＾＾＾＾＾＾＾＾＾＾＾＾
というコメントを辻井さんから戴きました。
アカメの幼生の同定ですが、僕が聞き及ぶ範囲では
（とはいえソースが小川健太郎なのですがね）、
宮崎県耳川では孵化後間もない個体が採集されているようです。
故に、宮崎県ではアカメが再生産されているのはまず間違いありません。

ところが、高知県ではまだ採集事例がないようなのです。
土佐湾も駿河湾に劣らず多様な魚類の宝庫であり、昔から多くの研究者・研究機関が
漁業者とも連携して素晴らしい実績を挙げてきたのですが、
その積み上げを以ってしても、
未だに孵化直後の個体採集に至っていない。

・・・・・・という現状から、研究者の間では客観的事実として
「高知県では再生産されていないのではないか→宮崎県から黒潮にのって
幼魚が回遊・定着しているのではないのか」
という説も定着しつつあるとかしてないとか。

で、高知県の研究者としては「再生産されている実証」をも射程にいれつつ
日々研究しているようなのですね。

つまり、「釣獲データくらいしか無い」のです。

参考：高知大学　海洋生物研究施設　ジャコ学研究室